長期以來,科學家知道藥物與蛋白質相互作用受量子作用力驅動,卻始終無法在生物中直接檢測,只能依靠計算模型推斷。如今,這種局面有望改變。據新一期《科學進展》雜志報道,美國得克薩斯農工大學研究人員開發出一種新型激光技術,可直接檢測生命體系中的量子作用力,不僅能實時觀察蛋白質內部的微觀變化,還能預測藥物與蛋白質的結合能力,為加速新藥研發提供了全新工具。
藥物能否發揮作用,很大程度上取決于它能否與目標蛋白精準結合。而決定這一過程的,除了化學鍵,還有一種名為π-π堆積的弱量子相互作用。這種量子力作用能幫助DNA和蛋白質維持穩定的三維結構,也是許多藥物能夠識別靶標的重要基礎。
然而,這種作用力極其微弱。過去,科學家只能借助X射線晶體學、質譜分析以及計算模型間接推斷它的存在,卻始終無法直接測量,也難以實時觀察它在生命體系中的變化。
此次,研究團隊開發出名為“熱穩定拉曼相互作用分析”(TRIP)的技術。該技術基于拉曼光譜原理,通過向樣品發射激光,并記錄返回的分子振動信號,本質上就像“傾聽”被激發化學鍵發出的旋律。
研究人員解釋,每一種化學鍵都有自己獨特的振動頻率,當發生π-π堆積時,苯丙氨酸中苯環的振動頻率會發生細微變化,就像樂手輕微跑調一樣。TRIP正是通過捕捉這些幾乎難以察覺的變化,將原本“看不見”的量子作用力轉化為可直接檢測的信號。
為驗證技術,團隊選擇了新冠病毒主蛋白酶作為研究對象。這種蛋白是病毒復制的重要靶點,只有兩個蛋白結合形成二聚體后才能發揮作用,而這一過程中恰好伴隨著π-π堆積變化。實驗表明,TRIP能實時捕捉這些變化,并與量子力學密度泛函理論計算結果高度一致。
研究人員隨后利用TRIP測試了多種抗病毒藥物,結果發現,藥物活性越強,其對應的振動信號也越明顯。這意味著,量子尺度上的相互作用能預測藥物與蛋白質的結合能力,為候選藥物篩選提供新的評價依據。
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